Sérgio Afonso exerce a atividade de designer desde 1985 e em 1988 integrou a equipa que fundou a ESAD – Escola Superior de Artes e Design, onde coordenou o Departamento de Informática e foi docente convidado da disciplina de Informática Aplicada ao Projeto, de 1995 a 2005. Foi diretor do Departamento de Projeto e Comunicação da ESAD até 2014. Foi fundador da Incubadora de Design do Mercado de Matosinhos, atual ESAD Design Cluster, e fundador da Casa do Design de Matosinhos em 2015. Integrou a Comissão Instaladora da Incubadora de Moda e Design da Fábrica de Santo Thyrso e representa a ESAD no projeto Art on Chairs, de Paredes.

Foi fundador e coeditor da revista PLI Arte & Design (de 2011 a 2016). Comissariou vários eventos de Design, dos quais se destacam: Espírito e Razão, exposição de Design alemão no Museu da Ciência e Indústria, em 2001; Civilization of Living — The Evolution of European Domestic Interiors, conferência e exposição na Câmara Municipal de Matosinhos, em 2003; Contaminação, exposição integrante da XIII Bienal Internacional de Arte de Vila Nova de Cerveira em Tomiño, Espanha, em 2005; TITAN Illustration in Design, concurso/exposição, em 2009/2010; o projeto de intervenção urbana Em Rede, em Matosinhos, 2009; a exposição Isidro Ferrer — 116 Carteles, no Espaço Quadra Matosinhos, em 2011; e S, M, L, XL Fashion and Design Week na Fábrica de Santo Thyrso, em 2013.

É sócio-gerente do CIFAD – Centro de Investigação e Formação em Artes e Design, titular da ESAD – Escola Superior de Artes e Design de Matosinhos, onde pertence à Direção Executiva. É sócio-fundador da esad—idea, Associação para a Promoção e Investigação em Design e Arte, onde atualmente exerce o cargo de Presidente da Direção Executiva.

Exerce o cargo de Vice-Presidente da Associação Dante Alighieri em Portugal (ASCIPDA). É fundador e membro do Board da Porto Design Biennale.